* Diadaptasi dari game RPG yang dibuat oleh Type-Moon.
Cerita ini mengambil latar waktu pada tahun 2015, era terakhir dimana sihir masih memiliki pengaruh yang kuat. Organisasi keamanan dan keselamatan manusia, Chaldea, didirikan untuk mengawasi dunia yang hanya bisa dilihat dengan sihir dan diukur dengan ilmu pengetahuan; termasuk untuk mencegah musnahnya umat manusia.
Berkat usaha dari banyak peneliti, masa depan manusia berhasil dipertahankan untuk 100 tahun ke depan. Akan tetapi, secara tiba-tiba, masa depan yang Chaldea jaga tersebut menghilang tanpa bekas. Musnahnya umat manusia pada tahun 2017 pun sekarang dapat dipastikan akan terjadi.
Penyebabya berasal dari kota Fuyuki pada tahun 2004. Di kota itu, terdapat sebuah “dunia tak terjamah” yang tidak pernah diketahui sampai saat ini.
Chaldea kemudian mengadakan sebuah “Ekspedisi Cawan Suci,” untuk memeriksa, menguak, dan kemungkinan menghancurkan permasalahan yang berdampak pada musnahnya umat manusia nanti.