Tahun 2061 M, Jepang kehilangan kedaulatannya. Orang-orang Jepang menghabiskan hari-hari mereka sebagai warga negara yang tertindas setelah terpolarisasi dan diperintah oleh empat faksi utama. Negara ini mulai maju menjadi yang terdepan setelah pengerahan AMAIM, senjata humanoid oleh masing-masing blok.
Suatu hari, Amou Shiiba, seorang anak laki-laki yang menyukai mesin bertemu dengan Gai yang seorang AI. Pertemuan itu membuat Amou terlibat dalam pertempuran untuk merebut kembali Jepang dengan mengemudikan AMAIM Kenbu buatan diri sendiri.